清华新闻网9月4日电 RNA的结构-功能商议是结构生物学的前沿热门和难点。由于RNA自己的柔性和分子量扫尾，应用传统的结构生物学设施，举例X射线晶体学、核磁共振或冷冻电镜对其进行结构商议十分难题。刻下，RNA的三维空间结构信息还十分少。为商议RNA的结构，可通过向RNA分子中位点特异性的引入一些探针或活性标记物（举例，金纳米颗粒， 顺磁探针， 荧光探针等），引入新的商议技巧（举例，X射线散射干预，电子顺磁共振，单分子荧光共振能量滚动等）淫淫网，发展RNA的整合结构生物学商议决策。
X射线散射干预（X-ray scattering interferometry， XSI）是基于小角X射线散射时代（SAXS）的一种新的分子标尺（molecular ruler）。通过向生物大分子位点特异性的标记上单个或成对的金纳米颗粒，通过SAXS实验，可提供20-400埃范围内的位点特异性距离信息，因而在生物大分子的结构与动态特质商议中具有极大后劲。面前卵白质和DNA的位点特异性标记时代已有多种决策，而RNA，脱落是长链RNA的位点特异性标记十分具有挑战性。刻下，RNA的位点特异性标记主如若通过固相化学合成完竣的，这一决策频繁对长度小于100个核苷酸的RNA适用，因而，刻下XSI的应用主要局限在短链RNA。
为毁坏位点特异性标记RNA分子量扫尾的瓶颈，试验XSI在长链RNA结构商议中的应用，发展RNA整合结构生物学决策，清华大学人命科学学院方显杨课题组应用包含NaM-TPT3非自然碱基核苷酸对的拓展遗传密码体系，通过化学合成碱基带有氨基修饰的TPT3（rTPT3A）（图1A），过程PCR和体外转录响应，在RNA中位点特异性地引入TPT3A，进一步应用NHS-氨基化学响应的高接收性，通过与氨酰基修饰的金纳米颗粒响应，缔造了长链RNA位点特异性金纳米颗粒标记的政策（图1B）。
图1 基于拓展遗传密码体系的长链RNA位点特异性金纳米颗粒标记时代相当在X射线散射干预中的应用淫淫网
登革病毒是迫切的病原体，通过蚊虫叮咬在东谈主类和其他动物中传播，对民众卫生健康产生极大恐吓。登革热病毒是单股正链RNA病毒，其基因组RNA的线性-环化构象调遣病毒的复制和致病性具有迫切作用，对其机理进行商议有着迫切兴味。该文接收登革病毒的位于基因组RNA3’非翻译区长度为97个核苷酸的3’SL元件和长度为719个核苷酸DENV-Mini RNA元件，离别代表线性化和环化基因组RNA，应用上述标记政策，收效完竣了位点特异性的金纳米颗粒的标记， 并应用XSI测定了筹备距离 （图1C）。XSI成果为范围内之前基于RNA二级结构揣摸提倡的线性-环化构象变化模子提供了迫切的实验数据的撑抓。
8月31日，方显杨课题组在《好意思国科学院院报》（PNAS）发表了题为“基于拓宽遗传密码转录的长链RNA位点特异性共价标记纳米颗粒时代”（Site-specific covalent labeling of large RNAs with nanoparticles empowered by expanded genetic alphabet transcription）的著述。
方显杨商议员为本文通信作家。清华大学人命学院2016级PTN博士生王岩为本文的第一作家。清华大学人命学院2014级本科生陈垚宜（当今德国Freie Universität攻读博士学位）在项指标先期探索中作出了迫切孝敬，2017级CLS博士生胡艳萍参与了部单干作。该神气受国度当然科学基金委大科学安设科学商议吞并基金重心撑抓神气、北京结构生物学高精尖篡改中心、清华-北大人命科学吞并中心的经费撑抓。好意思国阿贡国度实验室先进光源12-ID-B线站为小角X射线散射数据的收罗提供了撑抓。
好看的日本av原文默契：https://doi.org/10.1073/pnas.2005217117
供稿：人命学院
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